Adını bulunduğu semtten almış olan Haydarpaşa Asker Hastanesi, 1845 yılında bir yıllık bir çalışma ile tamamlanarak 1846 yılında hasta kabulüne imkan sağlanmıştır.
Hastane 1853-54 Kırım savaşları sırasında hasta ve yaralıların hizmetine tahsis edilmiştir. Hastane 1863 yılında birkaç yüz dönüm genişletilmiştir.
1286-1870 yılında hastane tıbbiyenin staj yeri olarak kabul edilmiştir. 1881 yılında 500 yatak alabilen hastanenin 1881 yılında mevcudu 900 ü geçmiş, kadrosu 750’ye çıkarılmıştır.
Hastane onarım nedeniyle 1933 yılı sonunda Selimiye Kışlası’na nakledilmiş 1940 yılında yeniden hizmete açılmıştır.
Zaman içinde gittikçe gelişen hastane 1 EKİM 1985 tarihinden itibaren “Gülhane Askeri Tıp Akademisi Haydarpaşa Eğitim Hastanesi” adını alarak yeni akademik yapısına kavuşmuş olup 2016 yılından itibaren Sağlık Bakanlığına Devredilmiştir.
